九华山最著名的有以下佛寺。

一、化城寺化城寺是九华山唯一的一座坐北朝南、呈轴线对称布局、由南向北逐渐升高的寺院,分前后四进,依山而建,有山门殿、天王殿大雄宝殿、藏经楼。建筑庄严古朴,恢宏高大,是九华山开山之寺和总丛林。据《安徽通志》记载,唐开元七年(719)24岁的新罗王室弟子金乔觉,剃发出家后携白犬于唐开元、天宝年间渡海来到中国,入九华山独居石室,岩栈土饭,苦修达数十年之久。据《九华山志》载,唐至德二年(757),居士诸葛节等,拓僧檀公旧址,建殿宇,延地藏居之;建中二年(781),刺史张岩,奉请寺额,朝廷赐“化城”匾额。明宣宗、神宗、清康煕、乾隆都曾赐匾额并赐金修葺。

二、肉身殿是全国重点寺院。原名金地藏塔。位于九华街神光岭。始建于唐代贞元年间。殿宇面阔3间，进深16米，地平铺汉白玉石。中央为1．8米高的汉白玉塔基，上矗七层八方木质宝塔一座，高17米。塔的每层八面背有佛龛，每龛均供奉金地藏金色坐像，供56尊，大小不一，以漆芋合塑造于清光绪十二年(1886年)。在塔北门外有个半月形瑶台，台上铸有三座大鼎。其一，置肉身殿北拜台东侧，高120厘米，口径109厘米；其二，置肉宝殿北拜台中，高120厘米，口径109厘米；其三，置肉身殿北拜台西侧，高120厘米，口径109厘米，此处比殿南正门前开阔得多，香客多到此烧香拜佛。

三、东崖寺东崖寺建在东崖,古称东峰,在化城寺东,崖上有一块巨石,形如苍龙昂首,有角有齿有鱗甲,上刻“石舫”二字,素有“东崖云舫之称。峰北有一黑色巨石,又称晏坐岩,相传为金地藏打坐之处东边的堆云润又名地藏洞,是金地藏居住过的地方。曾有晏坐堂,明万历年间扩建成寺。清中叶定慧和尚募化扩建大雄宝殿、万佛楼、地藏殿、禅房、静室等。现寺已毁于1933年,仅存钟亭,亭二层,六角,内悬古“幽鸣钟”,钟声深沉浑厚响遍九子峰。寺周有小观间峰、天池龙女泉、闵公墓和通慧神院、太白书堂遗址等。

四、甘露寺甘露寺在九华山北路半山腰的定心石下,据传清康熙十六年(1677)玉琳国师到九华山朝礼地藏菩萨,见该处景色雅致,山水环拱,苍松翠竹间有块平地可以建寺,使说“此处若筑蓝若,必代有高僧”。禅居伏虎洞20余年的苦行僧洞安法师听闻国师这番话后,欣然离洞出山,后四处奔走化缘,筹建佛寺,同治年间曾重修。清康熙年间由优县禅师住持,开坛传戒。咸丰末,梵宇全毁。光绪年间又由大航禅师募修,并住持甘露寺。他头戴斗笠足穿草鞋,步行万里去北京,延工请刻藏经,持归寺中。后来由常贤禅师住持谨遵佛制,增建殿宇。

五、祇园寺祗园寺位于九华山风景区九华街东北，插霄峰西麓。祗园寺为全国重点寺院。原名“祗树庵”，又名“祗园禅寺”。始建于明代，现存建筑为清代，清康熙年间为九华山化城寺东寮之一。与甘露寺、百岁宫和东岩禅林合称九华山四大禅林。

六、上禅堂始建于明代，清康熙六年(1667年)玉林国师徒弟宗衍重建。乾隆二十三年(1758年)住持僧忝石扩建观音殿。王文僖公赠额“秀观云林”。咸丰年间(1851-1861年)毁于兵燹。同治初年1862年)住持僧开泰募款重建。光绪年间(1875一1908年)，由清镛禅师续建万佛楼。

1925年住持僧霞光，因其慈善有功，倪前知事赠额“佛国元勋”。

1928年住持僧志芳重修大殿，安单接众，遂成为与百岁宫、东崖禅寺、祗园寺、甘露寺、莲花寺、乐善寺等九华山七大丛林之一。

七、天台寺天台寺又名“地藏寺”、“地藏禅寺”，位于安徽省青阳县九华山的天台峰顶，海拔1306米，为九华山位置最高的寺院。因天台是佛教徒朝拜地藏圣迹必到之处地，所以往往将天台称为九华山主峰，有到九华“不上天台，等于白来”之说。天台寺横卧于天台、玉屏峰间的凹地上，坐北朝南，块石木结构，硬山顶，是一座3层走马通楼的民居式殿宇。是1983年国务院确定的汉地佛教全国重点寺院之一。