生态工程是人类学习自然生态系统“智慧”的结晶，是生态学、工程学、系统学、经济学等学科交叉而产生的新兴学科。

它遵循的基本原理如下：

1、物质循环再生原理。例如：无废弃农业，沼气利用。

2、物种多样性原理。例如: 森林生态系统，草原生态系统。

3、协调与平衡原理。例如: 三北防护林，沙漠防护林，需适应当地地区情况。

4、整体性原理。例如：人类与自然整体性，动物与自然整体性。

5、系统学和工程学原理。例如：稻田养鱼养鸭，草原放牧。