区别在于：概念不同、作用不同。

1、概念不同。密码学包含了密码编码学和密码分析学。密码工程学侧着加密，即编码密码分析学侧重解密，即破译。

2、作用不同。密码学是关于如何在敌人存在的环境中通信，然而密码工程能够解决密码设计、分析、工程实现、应用管理过程。