南京大学有21个A类学科，其中天文学、地质学、图书情报与档案管理为A+ ，哲学等11个学科为A，理论经济学等7个学科为A—；东南大学有12个A类学科，其中建筑学、土木工程、交通运输工程、生物医学工程、艺术学理论为A+，电子科学与技术为A，仪器科学与技术等6个学科为A—。