山西农业大学有农学院（作物科学研究所）、植物保护学院（植物保护研究所）、动物科学学院（畜牧兽医研究所）、动物医学学院、草业学院、资源环境学院（农业环境与资源研究所）、园艺学院（园艺研究所、蔬菜研究所）、食品科学与工程学院（农产品贮藏保鲜研究所）、农业经济管理学院（农业资源与经济研究所）、生命科学学院、林学院、农业工程学院、信息科学与工程学院、公共管理学院（MPA教育中心）软件学院、城乡建设学院、马克思主义学院、创新创业学院、农业标准化学院、基础部、体育部、继续教育学院等