专科艺术志愿和普通志愿的投档方式是不同的。

1,专科艺术志愿的投档是根据考生的专业成绩和艺术特长进行评估，通常会进行专业课考试和艺术表演、创作等方面的选拔，最后按照成绩排名进行录取。

2,普通志愿的投档则是根据考生的综合成绩，包括高考成绩、文化课、专业课等方面的评定，并按照分数进行录取。不同的大学和专业可能有不同的录取要求和加权分数的设置。所以，专科艺术志愿和普通志愿在投档方式上有所差异，需要考生根据自己的兴趣和特长做出选择。