根据目前的政策，博士也分学术型和专业型，很多学校的专业型博士只招收专业学位硕士，而有些学校（如北医）的专业型博士基本上全留给本校的，外校学生无论学术型和专业型都不能报考。
名校的学术型博士一般情况下都是三年全在实验室，与专业型相比就业相对较难（尤其在北京上海等地），并且要参加3-5年的住院医师规范化培训。学术型的好处就是可以系统地学习一下科研。博士学位是需要通过国家认定的论文审查才可以取得，而论文的水平是通过发表在认定的刊物上来体现，这也就是所谓的学术型。反之很多人业务水平很高，但学术研究能力不高，很难发表高水平的论文，对于这些人的博士授予就不严格要求论文，就是所谓的专业型。但这都是非正规的分类。
