首先说一点，其实很多环境学和生态学，甚至是生物学和毒理学方面的期刊都会接收生态毒理学方面的论文。

下面列出几个我个人接触过的，可能是发表过论文或者做过审稿人的。当然，这些期刊水平有高有低，看你的需要和水平。高水平的像Environmental Science & Technology和Limnology and Oceanography，以前还是比较难发的。低水平的有开源期刊Journal of Environmental Protection (JEP)和Journal of Water Resource and Protection (JWARP)，还有今年MDPI的新刊Pollutants。中等水平的几个期刊你可以看看International Journal of Molecular Sciences (IJMS), Toxics, PLOS ONE, Sustainability, Human and Ecological Risk Assessment (HERA), Fresenius Environmental Bulletin等。中文期刊可以看看《环境科学》或者《农业环境科学学报》。还有一类是专门接收生态毒理学方面论文的，比如 Environmental Toxicology，Ecotoxicology，Ecotoxicology and Environmental Safety，Environmental Chemistry and Ecotoxicology，International Journal of Ecotoxicology and Ecobiology (IJEE)，Environmental Toxicology and Chemistry (ET&C), Aquatic Ecotoxicology。我个人感觉，在这些期刊中ET&C的名气似乎比较大，但是这个期刊闹过一阵两边收费的情况，所以后来很多人不愿意投了。我建议你查阅最新的影响因子。中文期刊的话我自己发过《生态毒理学报》，中国科学院生态环境研究中心主办的，总体感觉还可以。如果是第一篇论文或者比较初步的数据，也是个不错的选择。