温州大学有商学院，化学与材料工程学院，法政学院，生命与环境科学学院，机电工程学院，教育学院，体育学院，人文学院，建筑与土木工程学院，外国语学院，音乐学院，国际合作学院，美术与设计学院，成人(继续)教育学院，数学与信息科学学院，瓯江学院，物理与电子信息工程学院，城市学院。

其中瓯江学院与城市学院是独立的学院。