山东省建筑设计研究院内设八个综合设计分院（栋岭伟建筑设计事务所、第一设计分院、第二设计分院、第三设计分院、第四设计分院、第五设计分院、第六设计分院、第七设计分院），六个驻外设计分院（泰安建筑设计所、济宁建筑设计所、东营分院、日照分院、青岛分院、上海分院）和五个驻外分支机构，还有六个专业技术研究部门（建筑创作研究所、施工图审查中心、工程咨询中心 、规划景观设计研究所、鉴定加固设计研究所和项目管理公司），七个职能管理服务部门。

主要从事工业与民用建筑、规划、市政、环艺等综合设计和卫生、教育、旅游、金融建筑等专业设计业务，并进行工程勘察、工程地质、工程监理等项业务。