分子生物学领域的重组设计理念主要是针对质粒进行设计，即在空载体中插入你需要的研究的对象，最终获得的质粒带有空载体的部分特性，同时含有你需要研究的对象构成重组质粒。

目前获得重组质粒的方法很多，同源重组法，gateway方法，T5外切酶处理等等。