由于生产工艺要求，负压洁净室净化空调系统采用全新风系统。

全部空气量均采用外界空气，经过相应过滤器净化和温湿度处理后送入洁净室。洁净室排风口把室内空气送入排风管道，由排风机进行相应处理后排到室外。过滤器可根据当地大气压污染情况进行设置。过滤器一般采用4级过滤（G4粗效过滤器、F5中效过滤器、F8中效过滤器、H14高效过滤器）。全新风系统空调机组在设计时须考虑消毒问题，应专门设置消毒回风管，消毒时可形成回路对整个系统进行完全消毒。