协和医学院的本硕博连读（八年制）：第一阶段：医学预科阶段，五个学期，在清华大学生物系进行。

第二阶段：基础医学阶段，三个学期，在校本部基础医学院进行。第三阶段：临床医学阶段（含见习），四个学期，在校本部临床医学院进行。第四阶段：临床实习及科研训练，四个学期，其中毕业前8个月时间为科研训练课时间，必须在博士生导师的指导下，独立完成一项科研题目并通过答辩。