环境工程专业主要的课程有：水污染控制工程、大气污染控制工程、工程制图、环境规划与管理、环境生物化学、环境土壤学、环境微生物学、固废处理与处置、环境影响评价、高等数学、线性代数、概率论、大学物理、无机化学、分析化学、有机化学、物理化学、大学计算机基础、物理性污染控制、专业英语等。

环境工程专业主要研究自然资源的保护和合理利用、环境污染问题的改善和防治、环境质量的提高等方面的基本知识和技能，进行环境工程建设、环境监测、污染防治等；例如：饮用水的过滤和消毒等水处理工程的规划，空气、水资源污染物的监测和分析，土壤污染、水污染问题的改善和防治等。与环境科学相比，更侧重于工程设计和污染防治等方面。