山东农业大学南校区专业主要有：农学、植物科学与技术、种子科学与工程、中药资源与开发、园艺、茶学、设施农业科学与工程、农业机械化及其自动化、交通运输、电气工程及其自动化、自动化、机械电子工程、车辆工程、动物科学、动物医学、水产养殖、制药工程（兽药方向）、应用化学、材料化学、生物技术、生物工程等。

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