上海理工大学和南京理工大学都是在全国享有较高声誉的综合性大学，其民族预科班都是为了吸引和培养中国各个民族的优秀学生、推动我国民族教育事业的发展而建立的。

两所学校的民族预科班都注重培养学生的中文语言能力和相关学科知识，为学生的未来升学和就业提供良好的基础。具体来说，两所学校的民族预科班有以下几个区别：

1. 招生限制：上海理工大学民族预科班主要面向新疆籍或其他少数民族籍贯的考生，南京理工大学预科班面向全国各个民族的考生，招生范围更广。

2. 课程设置：两所学校民族预科班都注重中文语言能力的培养，但在其他课程设置上可能有所不同。例如，南京理工大学预科班可能更注重理工类学科的重点培养。

3. 学科优势：两所学校都是在理工科学科领域有较高的知名度和研究实力，但在专业设置和学科优势方面可能略有不同，具体取决于学生的个人兴趣和发展方向。因此，建议您在确认自己符合报考条件的前提下，仔细了解两所学校的民族预科班特色、课程设置、师资力量、毕业生就业情况等因素，权衡两所学校的优劣势，选择最适合自己的学校。