1，学习形式不同两者比较明显的区别在于学习形式：全职博士是脱产学习，意味着学生的主要时间将用于学业上；在职博士是半脱产学习，其课程教学时间相对来说更加灵活，学生一般在业余时间上课即可，此形式更符合职场人员的需求。
2，学习费用有较大差异两者的收取费用也存在较大区别：全职博士不同院校及不同专业需要的费用会有差异，但整体费用较低，且学生能够享受国家补贴，部分院校还设有奖学金；在职博士不同院校及不同专业需要的费用也有一定差异，但整体费用相较全职博士而言是比较高的，且学生基本不能够享受国家政策，对于学生自身的经济能力有较高要求。
