华侨大学医学院成立于2017年，学校前身是2006年12月成立的分子药物研究所成立，揭开华侨大学医药学科建设序幕。

2007年10月，华侨大学第一个教育部工程研究中心——分子药物教育部工程研究中心立项建设。以分子药物研究所和分子药物教育部工程研究中心为基础，2012年4月挂牌成立生物医学学院（泉厦两校区办学），2017年4月成立医学院，与生物医学学院合署办公。