中药学在南京农业大学的园艺学院。

中药材科学系创建于1985年，设置的中药学专业是我国部属高等农业院校中药学方向唯一的一个新兴特色专业，是一个跨越中药学和农学两大学科的交叉学科，坚持“世界眼光、中国情怀、南农品质”的人才分类培养理念，主要培养德、智、体、美全面发展，能适应现代化建设的需要，能从事中药现代科学研究、科技推广、经营管理以及教学等方面的工作，知识面宽、能力强、素质高，具有创新精神和实践能力，同时具备药用植物资源调查和持续利用、引种驯化、栽培育种等专业知识，并具有一定专长的拔尖创新型、应用型和复合型人才和能从事中药学相关的教学、科研、经营、管理等工作的高级专业人才。从2000年开始与相近学科合作招收硕士研究生，2003年建立了我国农林高等院校中第一个医学门类的中药学（理学）一级学科硕士点。

2004年设立药用植物二级学科博士点。