合川市目前有三所本科院校，分别是重庆工程学院合川校区、重庆师范大学涂山校区和西南大学合川校区。

其中，重庆工程学院合川校区是一所以工科为主的本科院校，主要开设机械工程、电气工程、计算机科学与技术等专业；重庆师范大学涂山校区是一所综合性本科院校，开设人文、理工、艺术等多个领域的专业；西南大学合川校区则是一所以农业、生态和环境科学为主的本科院校，主要开设生态学、生物学、环境科学等专业。这三所大学都是合川市的重要教育资源。