二者主要区别在于专业选择方面。

艺术类理科生在高考之前要参加省艺术联考和部分大学的单招考试，省联考分数有本科线和专科线之分，艺术联考或了本科线，且文化分也或了本科线，才可以填报本科院校，如果艺术联考没过本科线，即使文化分过了本科线，也不能填报艺术本科。而文化理科生，只要过了本科线，就可以填报本科院校中相应的专业。所以说二者主要区别在专业方面。