北京大学与北京大学医学系招生是分开的，但毕业证都写的北京大学。

北京大学由教育部直属，系国家“211工程”、“985工程”、“2011计划”建设的全国重点大学，是九校联盟（C9）及东亚研究型大学协会、国际研究型大学联盟、环太平洋大学联盟、东亚四大学论坛的重要成员。北京大学医学部（PUHSC），前身是国立北京医学专门学校，创建于1912年10月26日，是中国政府教育部依靠中国自己的力量开办的第一所专门传授西方医学的国立学校。2000年4月3日，原北京医科大学与北京大学正式合并，组建新的北京大学。2000年5月4日，北京医科大学正式更名为北京大学医学部。北医集教学、科研、医疗为一体，以本科教育、研究生教育为主，学科覆盖基础医学、临床医学、口腔医学、药学、预防医学、护理学等六大门类，专业齐全，基础医学口腔医学专业实行八年制，临床医学专业分为五年制和八年制两种。北京大学医学部是国家“211工程”和“985工程”首批建设的高等学校，是中国最重要的医学创新研究基地和高级医药卫生人才的培养基地之一。