731部队是述日本细菌部队的代称。

日本有七大细菌战部队，分别是：在日本东京的陆军军医学校细菌武器研究室。在哈尔滨的关东军659部队，其设于哈尔滨平房区的本部称731部队在长春的关东军100部队在北京的北支甲1855部队设于南京的荣字1644部队在广州的波字8604部队在新加坡的冈字9420部队陆军军医学校细菌武器研究室设立于日本东京陆军军医学校，位于日本东京新宿，对外称防疫研究室。关东军659部队本部设于哈尔滨平房区，对外称关东军队防疫给水部，其本部称为731部队。关东军100部队本部设于长春的,对外称关东军兽疫预防部,下设2630部队等。负责人高桥隆犊兽医中将和松有次郎兽医少将。北支甲1855部队本部设在北京的天坛公园西门南侧的神乐署，原国民党中央防疫处，对外称华北派遣军防疫给水部，后称第151兵站医院。

1855部队部长初为黑江，后为菊池齐。

1939年，西村英二继任。下设三个课：第1课设于协和医学院，从事细菌（生物）战剂的研究第2课设于天坛公园西门南侧,从事细菌生产。（现地址为北京市天坛西门中国药品生物制品检定所）第3课设于北海旁北京图书馆西，为细菌武器研究所此外，在济南、天津、太原、青岛、郑州、开封、郾城派驻支队等。荣字1644部队本部设于南京，对外称华东派遣军防疫给水部，在上海、南京、岳阳、荆门、宜昌等地派驻12个支队。波字8604部队本部设于广州，对外称华南派遣军防疫给水部。冈字9420部队本部设于新加坡，对外称南方防疫给水部。日本细菌部队在中国境内有五大部队，63个支队。

731部队行径只是大日本帝国陆军在占领满洲期间（从1931年到第二次世界大战结束的1945年）犯下的许多战争罪行之一，在这期间，1500万中国人，朝鲜人，菲律宾人，印度尼西亚人，缅甸人的平民，太平洋岛上居民和联军俘虏被杀害。