广州航海学院和惠州学院在院校历史、专业设置等各有优势，如果您倾向于海事类职业，希望在专业领域有深入研究，可以选择广州航海学院的海事管理或海事技术专业。

如果您更倾向于具有广泛学科的学校，希望在未来的就业中有更多的选择余地，可以选择惠州学院的文科或理科专业。详细对比如下：

1. 院校历史：广州航海学院始于1964年，历史悠久，并在2013年升级为本科学院。惠州学院则始于1946年，历史更为悠久，并于2000年升级为本科学院。两所学校都有着丰富的教育历史和传统。

2. 地理位置：广州航海学院位于广东省的经济和文化中心广州，具有便利的交通和丰富的城市资源。而惠州学院位于广东省惠州市，一个全国文明城市，环境宜人，适合学习和生活。

3. 特色专业：广州航海学院以海事专业为特色，具有深厚的海事教育背景和资源，如海事管理、海事技术等专业。而惠州学院开设有58个本科专业，涵盖文、理、工、经、管、教育、艺术等多个学科领域，可供选择的专业范围广泛。

4. 优势学科：广州航海学院的海事专业在国内具有一定的优势和影响力，是华南地区独立建制的海事本科院校。而惠州学院作为省属本科高校，其教育、工程、文科等学科同样有优势。

5. 科研实力：广州航海学院是广东省硕士学位授予立项建设单位，显示出其在海事领域的科研实力。惠州学院同样是省硕士学位授予立项建设单位，并被评为省级双创示范基地，表现出强大的创新和研究能力。请您根据以上分析，结合自身的兴趣和发展目标，谨慎选择学校和专业。