是的深职院校本部是南山校区。

1. 根据深职院的官方信息，深职院校本部位于南山校区，这是明确的。

2. 这个校区拥有完善的教学设施和资源，为学生提供良好的学习环境和条件，这是。

3. 此外，南山校区还靠近科技园和大学城等创新创业亮点区域，为学生提供更多的实践和就业机会，这是。