伊犁师范大学有以下硕士点：中国语言文学、数学、物理学、教育学、生物学、化学、法学、马克思主义理论学术型硕士研究生和教育、体育、法律、新闻与传播、资源与环境、旅游管理专业型硕士研究生 。

伊犁师大法学专业，教育学专业，化学专业，生物学专业，体育硕士专业，中国语言文学，数学，物理学专业等7个一级学科硕士学位授权点和3个硕士专业学位授权点。