深圳北理莫斯科大学成立后的前五年每年将招生300～500人，远期办学规模为5000人，将在语言文学、艺术文化、应用数学、信息技术、经济、地球科学、航空航天等莫斯科大学、北京理工大学的优势学科领域开展教学科研活动，在学科专业设置上文理工并重，并根据发展需要建立若干研究中心。

学校将采用汉语、俄语、英语三种语言进行教学，学生毕业可以拿到莫斯科大学和深圳北理莫斯科大学颁发的两个文凭。