福建农林大学金山学院与福建农林大学区别是性质不一样。

1、福建农林大学金山学院是2006年国家教育部批准成立的全日制本科层次独立学院。

2、福建农林大学是农业农村部与福建省政府共建高校、国家林业和草原局与福建省政府共建高校。是福建省一流大学建设高校、福建省重点建设3所高水平大学之一，属于公立院校。材料补充：福建农林大学金山学院与福建农林大学开设的院系：

1、福建农林大学金山学院：农业与生物技术系、食品科学系、人文社会科学系、经济与管理系、工程技术系、文学艺术系、文学艺术系。

2、福建农林大学：农学院、林学院、材料工程学院、蜂学学院、研究生学院、马克思主义学院。