东吴商学院有硕士专业。

苏州大学东吴商学院（财经学院）其前身为苏州财校，1982年并入苏州大学时成立的财经系。因与东吴证券股份有限公司签订协议共建苏州大学商学院，更名为苏州大学东吴商学院。东吴商学院有硕士点14个（金融学、财政学、企业管理、世界经济、区域经济、政治经济学、产业经济学、国际贸易、会计学、工商管理硕士（MBA）、会计专业硕士、金融专业硕士、税务专业硕士、国际商务专业硕士。