莫斯科工程物理学院的专业主要有：艺术与人文、考古学、建筑与建造环境、设计、古典文学与古代史、英语语言和文学、历史学、语言学、人力资源管理、光学信息技术、创新管理、商业信息学、国际科学技术、物理学、俄语、应用信息技术、应用数学、计算机应用系统、数学物理、组织心理学、物理与自然科学、理论和应用力学、化学。

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