正源学校的奥赛班和清华班在以下几个方面有所区别：

1. 选拔标准：正源学校的奥赛班一般会通过学生的奥数成绩进行选拔，而清华班则是通过专门的选拔考试或面试来筛选学生。

2. 课程设置：正源学校的奥赛班注重奥数的培训，主要开设数学课程，并进行奥数竞赛的模拟训练。而清华班则是提供全面的学科培训，除了数学外，还有语文、英语、理科等其他学科的课程。

3. 教学资源：清华班拥有清华大学的优秀师资资源，教师水平相对较高。而奥赛班的教师团队也会根据奥数培训的需求进行精选，但整体师资水平可能相对较低一些。

4. 学校背景：正源学校是一所综合性学校，相对来说教育资源可能较为有限。而清华班则是由清华大学创办或合作的，不仅学校背景更有名，也能提供更好的教育资源和平台。需要注意的是，以上区别仅是一般情况下的比较，具体情况会因学校的不同而有所差异。选取适合自己的奥赛班还是清华班，可以根据自己的实际情况和需求进行选择。