自然拼读是一种基于音素的拼读教学方法，可帮助学生更快更准确地掌握英语拼读技能。

在教学过程中，培训机构需要注重教学质量和教师素质，确保教学内容合法合规。同时，需要保证教学方式正确有效，避免对学生造成不良影响。在良好的教学环境下，自然拼读可以成为一种有益的教学方法，帮助学生更好地学习英语。因此，作为一种合法的教学方法，自然拼读是允许在培训机构进行教学的。