1966年停办大学的主要原因是文化大革命的爆发。
在这场运动中,大学被视为需要“彻底革命”的领域,因此受到了严重的冲击。具体来说,大学与国外高等教育发展脱离,接受和派遣留学生工作被强行停止;大学机构与中等教育机构的传统联系发生断裂,高考招生制度被强行废除;高深知识不再是联系大学内外部网络关系的主要因素,取而代之的是以“阶级斗争”为纲,宣扬“读书无用论”,停课闹革命,通过“斗批改”打倒“反动学术权威”,从而造成大学内外部关系极度混乱。随着文化大革命的结束和高考制度的恢复,中国的大学开始逐渐恢复正常的教学活动。需要注意的是,文化大革命是一场被反革命集团利用,给党、国家和各族人民带来严重灾难的内乱,留下了极其惨痛的教训。