吉首大学现有各类在籍学生3万余人，其中在校本科生、硕士生、博士生、留学生共2万人。

据学校官网显示，学校设有马克思主义学院、商学院、文学与新闻传播学院、法学与公共管理学院、美术学院、物理与机电工程学院等教学学院19个，一级学科41个，本科专业78个，覆盖了12大学科门类。学校设有有博士后科研流动站1个，“博士后科研流动站协作研发中心”1个；有一级学科博士点1个，一级学科硕士点15个，专业硕士点13个。学校有省重点学科5个（其中优势特色重点学科1个）、省“双一流”学科2个，国家民委重点学科2个。