华南农业大学博士学位一级学科有农业工程、生物学、作物学、园艺学、生态学、农业资源与环境、植物保护学、畜牧学、兽医学、食品科学与工程、草学、农林经济管理等专业。

华南农大1999年获得作物学博士后流动站。作物遗传育种学科1999年被评为农业部重点学科、2001年被评为国家重点学科、2006年再次被评为国家重点学科，作物学一级学科目前是广东省攀峰重点学科。