南京艺术学院共有12个系：美术学、绘画、雕塑，艺术设计学、艺术设计、工业设计、服装设计与工程，动画、摄影，音乐学、音乐表演、作曲和作曲技术理论，舞蹈编导、舞蹈学，表演、戏剧影视文学、导演、数字媒体艺术，艺术教育，公共事业管理，录音艺术、播音与主持艺术、广播电视编导、戏剧影视美术设计、广告。