斯坦福大学医学中心包括斯坦福医院和露西尔帕卡德儿童医院(Lucile Packard Childrens Hospital)。

斯坦福医院的历史起源于1911年成立的斯坦福儿童病愈中心，斯坦福医院的器官移植、癌症诊疗、心血管内科和外科以及神经科学都在世界享有盛誉。在《美国新闻与世界报道》周刊的美国较佳医院排名中斯坦福医院一直位列其中。它也是斯坦福大学医学院的主要教学医院，在培养医生和其他医疗工作人员中扮演了十分重要的角色。露西尔帕卡德儿童医院入选美国新闻与世界报道》周刊的美国十佳儿童医院，较引人注目的是这所医院是所有入选医院中较“年轻”的，它建于1991年。这所医院拥有较专业和卓越的医疗团队，共有1910名医务人员，另外有实习生和住院医生850名，还有将近1500名注册护士。医院共配有610张病床。斯坦福诊所(Stanford Clinics)，即斯坦福大学医学院大部分教学医生的联合执业诊所共包括493名教学和训练的全职医生。他们的专业领域覆盖了初级护理到较前沿的内科和外科。斯坦福诊所提供了一百多个专业科室和附属科室。在教学医生的指导下，斯坦福大学的医学生和住院医生参加了各个科室的患者医疗护理。这些诊所都参与了优先医疗保健项目以及医疗保险和医疗。斯坦福大学附属医学中心被大家一致认为是"全美较佳的十五间医院"之一，每年有近40,000名病患和20,000名住院病人在这里被痊愈。