哥本哈根大学硕士专业主要有：经济学、生物信息、国际健康、公共健康学、数学、计算机科学、食品科学与技术、森林与自然管理、地质学与地球科学、地理学与地质信息学、全球健康、人体生物学、人类营养学、信息技术与认知、园林（景观）建筑学、自然管理（景观、生物多样性和规划）、医疗化学、分子生物医学、纳米科学、药学、物理学、安全风险管理、统计学、农学、动物科学、人类学、应用文化分析、认知与传播学。

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