维尔茨堡大学设立的学院主要有：天主教神学院、法律学院、医药、文学院（艺术、历史、文学、文化和地理研究）、人文学院、生物学院、化学和药学院、数学与计算机科学学院、物理学和天文学院、经济和管理学院。

维尔茨堡大学设立的专业主要有：艺术教育、艺术史、航空和空间信息技术、生物化学、生物学、生物医学、工商管理、商业信息技术、商业数学、天主教神学、化学、古典研究、计算数学、计算机科学、文化景观、数字人文、教育、英美研究、欧洲民族学/民族研究、福音派神学、食品化学。材料补充：维尔茨堡大学的全称——尤利乌斯-马克西米利安-维尔茨堡大学，是当今德国境内历史最悠久的四所大学之一，也是德国巴伐利亚州的第一所大学。1402年，维尔茨堡大学在罗马教皇博义九世的授权下得以建立，经过衰落与重建，学校也逐渐形成了位于Grombühl的医学院校区、位于Dallenberg的植物系以及位于Hubland的Hubland Campus和Hubland Nord多个校区。JMU在所有研究领域提供博士学位，甚至在跨学科领域提供强化辅导和补充多学科课程，维尔茨堡大学还特地设立了研究生院以支持所有学科的博士生。