长崎大学是位于长崎县长崎市的日本著名一流研究型国立大学之一，大学医学部是旧制六大医科大学其中一所，俗称名门旧官六。长崎大学医学、化学、经济学等专业在日本学术界享有较高的声誉。和国内院校相比较的话，如果将医学部算在内相当于国内的中国人民大学，不算医学部大概就是末流985水平。

2021年QS世界大学排名，长崎大学排第531-540位；2020年U.S. News世界大学排名，长崎大学排第931位；2021年泰晤士高等教育世界大学排名，长崎大学排第1000+位；2020年软科世界大学学术排名，长崎大学排第801-900位。