东京大学和清华大学都是全球五十强的院校，如果从全球来看，几乎可以说不相上下。但是从就业的角度来看，如果说要是打算回国发展，那么毫无疑问，清华大学的文凭要高于东京大学。

2021年QS世界大学排名，东京大学排第24位，清华大学排第15位；2020年U.S. News世界大学排名，东京大学排第74位，清华大学排第36位；2021年泰晤士高等教育世界大学排名，东京大学排第36位，清华大学排第20位；2020年软科世界大学学术排名，东京大学排第26位，清华大学排第29位。