耶鲁大学和麻省理工学院相比的话，整体上来看麻省理工学院要好一些。耶鲁大学以人文社科、法律、公共政策、艺术及基础学科最有名，理工科在美国顶级院校里相对较弱。麻省理工学院素以顶尖的工程学和计算机科学而著名，其余的学科如物理学、化学、经济学、哲学、政治学、建筑学也都非常优秀。

2021年QS世界大学排名，耶鲁大学排第17位，麻省理工学院排第1位；2020年U.S. News世界大学排名，耶鲁大学排第12位，麻省理工学院排第2位；2021年泰晤士高等教育世界大学排名，耶鲁大学排第8位，麻省理工学院排第5位；2020年软科世界大学学术排名，耶鲁大学排第11位，麻省理工学院排第4位。