约翰霍普金斯大学和纽约大学相比的话，整体上来看约翰霍普金斯大学要好一些。霍普金斯大学不仅拥有全球顶级的医学院、公共卫生学院、国际关系学院，其生物工程、空间科学、社会与人文科学、金融经济、音乐艺术等领域的卓越成就也名扬世界。纽约大学在哲学、数学、医学、会计与金融、法律、表演艺术、计算机科学等多个学科拥有世界顶尖的学术资源，研究生院享有极高声誉。

2021年QS世界大学排名，约翰霍普金斯大学排第25位，纽约大学排第35位；2020年U.S. News世界大学排名，约翰霍普金斯大学排第11位，纽约大学排第28位；2021年泰晤士高等教育世界大学排名，约翰霍普金斯大学排第12位，纽约大学排第26位；2020年软科世界大学学术排名，约翰霍普金斯大学排第15位，纽约大学排第27位。