耶鲁大学和斯坦福大学相比的话，整体上来看斯坦福大学要好一些。耶鲁大学以人文社科、法律、公共政策、艺术及基础学科最有名，理工科在美国顶级院校里相对较弱。斯坦福大学学科在世界排名均处于领先地位，尤其在统计与运筹学、电气工程学、计算机科学、医学、商学、社会科学等多个学科领域拥有世界级的学术影响力。

2021年QS世界大学排名，耶鲁大学排第17位，斯坦福大学排第2位；2020年U.S. News世界大学排名，耶鲁大学排第12位，斯坦福大学排第3位；2021年泰晤士高等教育世界大学排名，耶鲁大学排第8位，斯坦福大学排第2位；2020年软科世界大学学术排名，耶鲁大学排第11位，斯坦福大学排第2位。