医学、自然科学、社会科学和人文学、犹太研究学、戏剧学，媒体研究等。

柏林自由大学的教学和研究领域广泛，其中医学、自然科学、社会科学和人文学系是柏大较大的院系。柏林自由大学还拥有人文和社会科学领域不少的“小专业”，比如犹太研究学、戏剧学，媒体研究等备受欢迎。

学校还成立了多个有关世界冲突的区域性研究所，如北美肯尼迪研究所、拉美研究所、东欧研究所等。

自然科学研究重点在于跨数学、物理和信息科学的生物和地理学研究。研究领域从日常文化到酵素的微生物分析和量子理论。

人文、社科和自然科学领域的研究面向国际，进行跨学科合作。