加州大学圣地亚哥分校的学士通识教育学院系统是该校的一个特色，其学院体系源自牛津大学和剑桥大学的英国学院制，类似于《哈利·波特》中的学院体系。学校有七个风格不同的学士学院，学院的设置与专业无关，但是每个学院都有自己的特色和偏向，有的鼓励学生的自我意识，有的强调公民的社会责任和信念，还有的旨在提高学生的领导力，培养世界公民。在美国鲜有大学采用这种体系，普林斯顿大学和加州大学圣克鲁兹分校亦采用这一学院体系。

七个通识教育学院包括：

Revelle College （罗杰·瑞弗尔学院）

John Muir College （登巴·缪尔学院）

Thurgood Marshall College （瑟古德·马歇尔学院）

Earl Warren College （厄尔·沃伦学院）

Eleanor Roosevelt College （埃莉诺·罗斯福学院）

Sixth College （第六学院）

Seventh College（第七学院）