马来西亚博特拉大学有以下博士专业：教育行政管理、教育心理学、教育技术、校外教育、谘商与辅导学、人力资源发展、道德教育、体育教育、教育社会学、航天航空工程、农业机械化和自动化、农业加工工程、农业机器人技术工程、农业废弃物工程、汽车工程学、生物化学工程、生物医学工程、生物过程工程、化学工程、通讯与网络工程、环境分析及建模、环境经济学、环境教育、环境伦理学、环境水文地理和水文地质、环境规划及管理、环境政策及管理、环境污染控制技术、环境质量及保护、环境系统及处理、海洋及淡水生态系统。

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