1582年，与早年许多在教廷允许（Papal Charter）成立的大学不同，爱丁堡大学在苏格兰国王詹姆斯六世（James VI）的允许（Royal Charter）和爱丁堡市议会(Town Council)的资助下展开筹建。

翌年，大学正式成立，作为欧洲宗教改革运动之后的第一所市立大学（Civic University），其最初的名称是“唐尼斯学院”（Tounis College），是苏格兰的第四所也是整个英语圈的第六所大学。翌年，大学正式成立，作为欧洲宗教改革运动之后的第一所市立大学（Civic University），其最初的名称是“唐尼斯学院”（Tounis College），是苏格兰的第四所也是整个英语圈的第六所大学。翌年，大学正式成立，作为欧洲宗教改革运动之后的第一所市立大学（Civic University），其最初的名称是“唐尼斯学院”（Tounis College），是苏格兰的第四所也是整个英语圈的第六所大学。