维尔茨堡大学的专业主要有：艺术教育、艺术史、航空和空间信息技术、生物化学、生物学、生物医学、工商管理、商业信息技术、商业数学、天主教神学、化学、古典研究、计算数学、计算机科学、文化景观、数字人文、教育、英美研究、欧洲民族学、食品化学、功能材料、地理、德国研究、历史、生命科学、语言学、数学物理、博物馆学、音乐教育、音乐学、纳米结构技术、哲学、哲学与宗教、物理学、政治与社会研究、公法、浪漫语言与文学。

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