全校共设有14个提供学位课程的学院及一个继续教育学院。

其中提供本科教育的学院有两所，即哈佛学院和延伸教育学院。提供研究生教育的学院11所，即文理研究生学院、哈佛商学院、哈佛肯尼迪学院、设计研究生学院、教育研究生学院、法学院、神学院、医学院、牙医学院、公共卫生学院，拉德克里夫高级研究所等，提供涵盖上百个学科领域的数百个专业供学生选择。